Le manuel de sécurité hyperbare (MSH) est le document de référence pour l'organisation des travaux en milieu hyperbare. Établi par l'employeur à partir de son évaluation des risques professionnels, il définit notamment les procédures de travail, les règles de sécurité à respecter, les équipements requis, les procédures d’alerte et d’urgence. Il doit être régulièrement mis à jour et disponible sur le chantier.
Chaque travailleur doit disposer des qualifications et de l'aptitude médicale adaptées à son activité, recevoir une notice de poste l'informant des risques et des mesures de prévention, ainsi qu'un livret individuel assurant le suivi de son exposition au risque hyperbare.
Enfin, chaque intervention fait l'objet d'une fiche de sécurité retraçant les principales caractéristiques de la plongée ou des travaux réalisés afin d'assurer la traçabilité des expositions.